Arbetar med forskning som projektledare och utförare i mer än 30 år inom områdena biologisk nedbrytning av organiskt material för biogasproduktion och minskat läckage av kemiska bekämpningsmedel genom biobäddar och biosanering av förorenade jordar. Utför laborationer, pilotstudier, genomförbarhetsstudier och utredningsuppdrag.
Arbetar för närvarande som forskare med ansvar för karaktärisering av biogassubstrat, bestämning av biokemisk metanpotential och optimering av biogasprocesser i laboratorieskala i kontinuerliga reaktorer (CSTR, UASB, pluggflödesreaktor, mm.) vid RISE Biogas Laboratorie. Castillo har under de senaste åren arbetat med utveckling och optimering av laboratorieprocesser för biologisk sulfatreduktion i industriellt processvatten. Arbetar i nära samarbete med flera universitet och företag.